Cieľom Informačného systému monitoringu je vytvoriť homogénny, previazaný celok informačných zdrojov jednotlivých ČMS, schopný podať čo najobjektívnejšiu výpoveď o stave zložiek životného prostredia a naň pôsobiacich vplyvov. 
        Monitoring  životného  prostredia,   spolu  s informačným systémom tvoria  jeden prostriedok   nevyhnutný v  procese rozhodovania sa v oblasti ochrany a tvorby životného prostredia. Dosiaľ bol zabezpečovaný vzájomne nedostatočne previazanými čiastkovými monitorovacími systémami. 

 V roku 1996 začal platiť zákon NR SR č. 261/1995 Z.z., zo dňa 14.11.1995 o Štátnom informačnom systéme (ďalej ŠIS), podľa ktorého bola pre rezort životného prostredia v priebehu prvého polroka 1996 spracovaná Koncepcia rezortnej časti štátneho informačného systému MŽP SR, schválená ministrom ŽP dňa 27.6.1996. MŽP SR poverilo, v zmysle schválenej Koncepcie, budovaním a prevádzkovaním Informačného systému monitoringu Slovenskú agentúru životného prostredia Banská Bystrica.